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Biotin 标记棕榈酸探针生物素-棕榈酸Biotin-C16的应用

2026-10-15 [20]

生物素 - 棕榈酸(Biotin-Palmitic acid),也常称为生物素化棕榈酸,是棕榈酸(十六烷酸,C16:0)通过连接臂共价偶联生物素的脂肪酸探针,属于蛋白脂修饰化学探针,主要用来模拟棕榈酸,标记细胞内发生 S - 棕榈酰化(S-palmitoylation)的蛋白,依托生物素 - 链霉亲和素系统实现富集鉴定,是棕榈酰化修饰组学的经典工具分子。

一、分子结构解析

结构式简写:Biotin-Linker-Palmitic acid

脂链母核:棕榈酸,直链饱和 C16 脂肪酸,是细胞内 S - 棕榈酰转移酶(ZDHHC 家族)的天然底物;棕榈酰化通常将棕榈酸共价连接在蛋白半胱氨酸巯基上,调控膜蛋白膜定位、稳定性、蛋白互作。

亲和标签:生物素,用于链霉亲和素磁珠捕获、富集被标记的棕榈酰化蛋白。

连接臂:常用 C2/C4、PEG 短 linker;偶联位点一般在棕榈酸羧基端延伸 linker 接生物素,尽量保留烷基长链的疏水性,保证可被 ZDHHC 酶识别、转运至膜区。

二、合成路线

酰胺缩合

1.选用带氨基 linker 的生物素(Biotin-NH2);

2.棕榈酸在无水 DMF 中用 HATU/DIEA 活化羧基;

3.和 Biotin-NH2 室温避光酰胺化反应;

4.制备 HPLC 纯化(C18 反相,乙腈 / 水体系);

5.冻干,HRMS、NMR、HPLC 质控,纯度≥95%;按需做成 NHS 活化酯衍生物。

三、应用方向

棕榈酰化修饰组学:全局鉴定细胞内 S - 棕榈酰化底物蛋白;

ZDHHC 转移酶底物筛选、酶活抑制剂筛选;

膜蛋白脂修饰研究:GPCR、离子通道、小 G 蛋白棕榈酰化功能验证;

脂代谢、脂质转运示踪;

验证蛋白棕榈酰化对膜定位、蛋白相互作用的调控。


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