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请详细介绍一下DBCO-Cy5.5的合成方法。

2026-01-30 [7]

DBCO-Cy5.5 的合成方法通常涉及将 Cy5.5 荧光染料与 DBCO 基团通过化学方法偶联在一起,以下是详细的合成步骤及说明

一、原料准备

  • Cy5.5-NHS 酯(或羧酸活化形式):作为荧光染料部分,提供荧光信号。

  • DBCO-胺(或 DBCO-羟基衍生物):作为点击化学反应基团,提供与叠氮基团反应的能力。

  • 缩合剂:如 EDC·HCl(1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺盐酸盐)和 NHS(N-羟基琥珀酰亚胺),用于活化羧酸基团,促进偶联反应。

  • 溶剂:如 DMSO(二甲基亚砜)、DMF(N,N-二甲基甲酰胺)等极性溶剂,用于溶解原料和反应物。

二、合成步骤

  1. 溶解原料

    • 将 Cy5.5-NHS 酯与 DBCO-胺按 1:1.2 的摩尔比溶于适量的 DMSO 或 DMF 中。确保原料全溶解,形成均匀的溶液。

  2. 活化羧酸基团

    • 向溶液中加入 EDC·HCl 和 NHS,以活化 Cy5.5-NHS 酯中的羧酸基团。这一步骤有助于促进后续的偶联反应。

    • 室温下搅拌溶液,使活化反应充分进行。通常需要搅拌数小时至过夜,以确保活化全。

  3. 偶联反应

    • 在活化后的溶液中,Cy5.5-NHS 酯的活化羧酸基团将与 DBCO-胺的氨基发生偶联反应,形成酰胺键。

    • 继续室温搅拌反应液,使偶联反应充分进行。反应时间通常为 12-24 小时,具体取决于反应条件和原料的浓度。

  4. 后处理

    • 反应完成后,通过减压旋蒸除去溶剂,得到粗产物。

    • 使用制备型 HPLC(高效液相色谱)或柱层析(流动相:乙腈/水含 0.1% TFA)对粗产物进行纯化,以去除未反应的原料和副产物。

    • 收集纯化后的产物,冻干得到 DBCO-Cy5.5 的纯品。

三、注意事项

  • 反应体系需干燥:在合成过程中,应确保反应体系干燥,以避免水解等副反应的发生。

  • 控制反应温度:反应温度通常控制在室温至 50℃ 之间,具体取决于反应条件和原料的稳定性。

  • 纯化与表征:纯化后的产物应通过质谱、核磁共振等技术进行结构表征,以确保其纯度和结构正确性。

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