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生物素-5-甲基尿苷Biotin‑5‑methyluridine|RNA 修饰亲和探针

2026-10-15 [21]

生物素-5-甲基尿苷(Biotin-5-Methyluridine)‌是生物素与5-甲基尿苷(核糖胸苷)通过共价键偶联得到的功能化核苷衍生物,属于生物素标记的表观遗传修饰核苷探针,是RNA修饰示踪、表观转录组学研究领域的核心科研工具。

一、基础信息

‌别名‌:生物素化5-甲基尿苷、Biotin-m5U

外观性状‌:白色至类白色结晶性粉末

5-甲基尿苷,也叫 核糖胸苷 / ribothymidine,CAS 1463-10-1,分子式 C₁₀H₁₄N₂O₆,分子量约 258.23。
它是胸腺嘧啶与核糖组成的嘧啶核苷,属于人体内源性甲基化核苷之一。

二、核心特性

‌双重功能协同‌:同时保留5-甲基尿苷的天然表观遗传修饰属性与生物素的高特异性亲和识别特性,模拟细胞内天然m5U修饰核苷的代谢掺入过程,不会干扰RNA的正常转录与折叠过程

‌超高亲和力链霉亲和素识别‌:偶联的生物素基团可与链霉亲和素发生Kd≈10⁻¹⁵ mol/L的非共价结合,是构建生物素-链霉亲和素级联富集体系的核心功能分子,富集效率远高于普通抗体免疫沉淀方法

‌优异生物相容性‌:5-甲基尿苷本身是tRNA、rRNA中广泛存在的天然表观修饰核苷,无细胞毒性,生物素是人体必需维生素,无免疫原性,可直接用于活细胞代谢标记实验

‌高化学稳定性‌:分子中的糖苷键与酰胺键在生理pH环境下高度稳定,不会在细胞内代谢过程中发生非特异性断裂,保证标记信号的精准性

三、主要用途

‌RNA表观修饰示踪‌:作为代谢标记前体,被活细胞摄取后掺入新生RNA链中,精准追踪细胞内5-甲基尿苷修饰的动态生成、分布与代谢过程,是表观转录组学研究m5U修饰的核心工具

‌m5U修饰位点富集测序‌:通过链霉亲和素磁珠的特异性捕获,从复杂细胞总RNA中高效富集含m5U修饰的RNA片段,大幅提升m5U修饰位点测序的检测灵敏度与覆盖度,解决传统抗体富集方法的非特异性背景高的痛点

‌RNA-蛋白相互作用研究‌:将生物素-5-甲基尿苷标记到目标RNA分子中,通过链霉亲和素 pull-down 实验高效捕获与该RNA结合的蛋白复合物,精准鉴定RNA结合蛋白的身份,解析RNA-蛋白相互作用网络

‌核酸探针功能修饰‌:作为功能化核苷单体,通过固相合成技术引入siRNA、反义寡核苷酸等核酸药物分子中,利用生物素的靶向特性提升核酸药物的细胞摄取效率与体内靶向富集效果

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