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UDP-diBAcNAc,UDP‑diNAcBac,UDP-MurNAc的合成路径

2026-10-27 [8]

UDP-diBAcNAc(尿苷二磷酸-N,N'-二乙酰基胞壁酸,也常简称UDP-MurNAc)‌ 是细菌细胞壁肽聚糖生物合成通路中的核心关键前体糖核苷酸衍生物,仅天然存在于细菌代谢体系中,是新型窄谱抗菌药物开发的核心靶点工具分子。


一、核心理化性质

  • 外观为白色至类白色冻干粉或固体粉末,极性比较强,易溶于水、DMSO等极性溶剂,几乎不溶于氯仿等非极性有机溶剂。

  • 分子结构由尿苷二磷酸(UDP)骨架与N,N'-二乙酰基胞壁酸单元通过高能焦磷酸键连接而成,糖环C3位带有独特的乳酸残基修饰,紫外特征吸收峰位于260 nm附近,可通过该特征峰完成产物初步定性鉴定。

  • 生理条件下性质相对稳定,对强酸碱、高温敏感,焦磷酸键易水解失活,推荐使用pH范围为6.0-7.5,-20℃密封避光条件下可稳定储存1年以上。

二、合成路径

主流采用‌细菌内源多酶级联催化合成法‌制备,反应选择性比较高、副产物极少:

  1. 以天然UDP-GlcNAc为起始底物,在胞壁酸合成酶MurA催化下,将磷酸烯醇式丙酮酸(PEP)转移至UDP-GlcNAc的3位羟基上,生成UDP-烯醇式丙酮酸-N-乙酰葡萄糖胺中间体。

  2. 再在MurB还原酶催化下,将上述中间体的双键特异性加氢还原,一步生成目标产物UDP-diBAcNAc。
    后续通过阴离子交换色谱、凝胶过滤色谱两步纯化,去除未反应的底物与酶蛋白,冻干后得到高纯度的冻干粉产品。

三、科研应用

  • ‌细菌细胞壁肽聚糖合成机制研究‌:作为细菌的核心代谢中间体,直接参与肽聚糖骨架的生物合成过程,是细菌维持细胞形态、抵御外界渗透压压力的必需物质,阻断该合成通路可直接导致细菌裂解死亡。

  • ‌新型抗菌药物靶点开发‌:UDP-diBAcNAc合成通路中的MurA、MurB等关键酶是抗生素开发的核心靶点,经典抗生素磷霉素正是通过特异性抑制MurA酶活性,阻断UDP-diBAcNAc的合成,从而实现高效抗菌效果,该分子是新型抗菌药物筛选与酶活验证的核心工具底物。

  • ‌细菌-宿主相互作用机制研究‌:细菌细胞壁上的二乙酰基胞壁酸残基糖共轭物可直接参与细菌与宿主细胞的识别、粘附过程,同时可被宿主免疫系统特异性识别触发免疫响应,该分子是解析细菌免疫逃避机制的关键研究工具。

  • ‌合成生物学与糖工程应用‌:作为细菌的稀有糖核苷酸,可用于人工合成带有二乙酰基胞壁酸修饰的特征性肽聚糖片段,开发针对致病菌的新型糖结合疫苗候选抗原。


image.png


CMP-C5-alkyyl-Sialic Acid

108320-87-2UDP-N-acetylgalactosamine

UDP-GalNAc

15839-70-0GDP-Fuc                   GDP-Fucose

103301-73-1GDP-Mannose

GDP-Man           

3063-71-6CMP-N-acetylneuraminic acid

CMP-Neu5Ac

108320-89-4,3616-06-6"UDP-Xylose

UDP-Xyl

63700-19-6UDP-glucuronic acid

UDP-GlcA

137868-52-1, 

2956-16-3UDP-galactose

UDP-Gal

91183-98-1"UDP-N-acetylglucosamine

UDP-GlcNAc

117756-22-6, 28053-08-9"UDP-Glucose

UDP-Glc

98300-80-2CMP-N-glycolylneuraminic acid

CMP-Neu5Gc