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UDP-VioNH2,尿苷二磷酸紫霉素糖胺,UDP‑D‑Viosamine的信息

2026-10-28 [10]

UDP-VioNAc 即 UDP-N-乙酰维诺糖胺,是 UDP-Vio 的 N-乙酰化形式,糖部分为 4-氨基-4,6-二脱氧-D-甘露糖的 N-乙酰化衍生物。 

一、理化参数

  • ‌别名‌:VioNH₂-UDP

  • ‌分子式‌:C₁₅H₂₅N₃O₁₅P₂

  • ‌分子量‌:约549.32 g/mol

  • ‌外观‌:白色至类白色固体或冻干粉末

  • ‌溶解性‌:易溶于水,在DCM、DMF、DMSO、THF等多数常规有机溶剂中也有良好溶解性

  • ‌光谱特征‌:260 nm处有尿嘧啶碱基的特征紫外吸收峰

  • ‌纯度标准‌:商用科研级产品纯度≥95%,经NMR完成完整结构确证

  • ‌储存条件‌:-20℃以下密封避光干燥保存,避免反复冻融,高温、酸碱环境下易发生焦磷酸酯键水解断裂

二、合成路径

该分子依赖化学-酶偶联法人工定制合成,主流制备流程分为两步:

  1. 先通过选择性脱乙酰的化学合成路径,将UDP-VioNAc的2位乙酰氨基水解为游离氨基,避免副反应生成。

  2. 再经离子交换层析和制备型HPLC两步纯化,去除残留的原料和副产物,即可得到高纯度的UDP-VioNH₂终产物。
    也可通过重组表达的脱乙酰酶直接催化UDP-VioNAc的N-乙酰基水解,一步得到目标产物,大幅简化合成流程。

三、科研应用

  • ‌氨基糖苷类抗生素生物合成研究‌:作为紫霉素等氨基糖苷类抗生素生物合成的特殊底物类似物,用于解析抗生素分子中紫霉素糖胺单元的组装机制,发现未被报道的新型糖基转移酶功能。

  • ‌细菌核苷酸糖代谢研究‌:作为特殊底物类似物,用于探究细菌体系中的稀有脱氧氨基糖代谢通路,拓展糖工程的工具酶库。

  • ‌生物正交标记实验‌:分子中的游离氨基位点可高效连接荧光染料、生物素、DBCO等功能基团,用于细胞表面特殊糖链的定点标记与成像示踪,大幅提升稀有糖链可视化研究的灵敏度。

  • ‌新型抗生素改造优化‌:通过定向引入VioNH₂糖基化修饰,优化氨基糖苷类抗生素的水溶性、药理活性与耐药菌靶向性,加速新型抗感染先导化合物的筛选进程。

结构式

image.png



UDP-galacturonic acid

UDP-GalA

CMP-N-glycolylneuraminic acid

CMP-Neu5Gc

UDP-L-Rhamnose 

UDP-L-Arabinose 

GDP-ManA

GDP-PerNH2

GDP-Rhamnose

GDP-6-deoxy-D-talose

GDP-L-Colitose

GDP-L-galactose

GDP-PerNAc

UDP-VioNH2

UDP-VioNAc

UDP-ManNAcA

UDP-D-QuiNAc

UDP-GlcNAcA

UDP-D-XylNAc

UDP-4n-D-FucNAc