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GDP-6-叠氮-L-岩藻糖|GDP-6-N3-L-Fuc|GDP-叠氮岩藻糖的核心科研用途

2026-08-21 [122]

GDP-6-N3-L-Fuc是糖生物学领域常用的非天然活化岩藻糖核苷酸探针,以下是其完整核心信息:

一、基础标识信息

‌中文全称‌:GDP-6-叠氮-L-岩藻糖二钠盐

‌英文全称‌:Guanosine 5'-diphosphate 6-azido-6-deoxy-L-fucose disodium

‌别名‌:GDP-6-Az-L-Fuc、GDP叠氮岩藻糖

结构式

image.png


二、核心理化参数

分子式‌:C₁₆H₂₂N₈O₁₅P₂Na₂

分子量‌:674.32

外观性状‌:白色-类白色冻干粉末

溶解性‌:易溶于水、中性PBS,几乎不溶于常规有机溶剂

三、核心结构特征

天然GDP-L-Fuc的L-岩藻糖C6位甲基替换为叠氮基团(-N₃),完整保留GDP焦磷酸活化基团,可直接作为岩藻糖基转移酶的糖供体使用,是生物正交岩藻糖标记的核心工具分子。

四、主流合成路径

采用定向酶催化偶联策略:

以L-岩藻糖为起始原料,通过岩藻糖激酶催化生成L-岩藻糖-1-磷酸

与鸟苷三磷酸在岩藻糖-1-磷酸尿苷酰转移酶的催化下偶联生成终产物

反应全程温度控制在30-37℃,pH维持在7.0左右,避免焦磷酸键水解断裂

五、核心科研用途

‌岩藻糖基转移酶生化研究‌:用于FUT、POFUT1/POFUT2酶活测定、酶动力学分析、抑制剂筛选,对比不同人源岩藻糖转移酶对非天然糖供体的底物偏好性

‌糖蛋白定点标记‌:体外酶促构建叠氮标记的岩藻糖化糖蛋白,后续通过点击化学、链霉亲和素磁珠富集、LC-MS/MS鉴定岩藻糖修饰位点

‌糖生物学体外重构‌:用于O-岩藻糖(Notch EGF/TSR结构域)、核心岩藻糖、Lewis抗原的体外糖链重构实验

‌糖核苷酸分析标准品‌:作为LC-MS分析的参照物质,用于复杂生物样本中岩藻糖核苷酸的定性定量校准





137868-52-1,UDP-Gal

17479-04-8,UDP-GIcNH2

CMP-9-N3-Neu5Ac

LacNAc-ProN3

GDP-6-N3-L-Fuc

CMP-Neu5Az

CMP-Neu5Ac cas3063-71-6

15839-78-8,UDP-L-Ara

551-85-9,D-核酮糖-5-磷酸酯

98924-81-3,Ac4GIcNAz

653600-56-7,Ac4GalNAz

361154-30-5,Ac4ManNAz

63700-19-6,UDP-GIcA

6815-91-4,GDP-L-Gal

LacNAc-ProN3

26575-17-7,UDP-ManNAc

71662-09-4,D-Fructose 1-phosphate disodium

GDP-L-Fuc-6-PEG4-Biotin